Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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