Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nup88Q8CEC0 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nup88Q8CEC0 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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