Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCS6

Pabpn1, Polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1Q8CCS6 Cfap46-202ENSMUST00000129990 8180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Sorbs2-215ENSMUST00000135336 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Olfr572-202ENSMUST00000214096 1126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Gcnt2-201ENSMUST00000067778 4038 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Lgals8-207ENSMUST00000143693 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pabpn1Q8CCS6 Slc2a9-203ENSMUST00000067886 3602 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Epb41-201ENSMUST00000030739 6565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Gm44883-201ENSMUST00000206063 3258 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Wee2-201ENSMUST00000038907 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Thada-201ENSMUST00000047524 7884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Smc2-201ENSMUST00000102915 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pabpn1Q8CCS6 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms