Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Ccdc88cQ6VGS5 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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Ccdc88cQ6VGS5 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Ccdc88cQ6VGS5 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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Ccdc88cQ6VGS5 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc88cQ6VGS5 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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