Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Zmym5-202ENSMUST00000111285 5351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms