Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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