Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Skap2Q3UND0 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Vps29-202ENSMUST00000117868 720 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Skap2Q3UND0 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms