Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Rapgef5-206ENSMUST00000222185 5508 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Lingo2-204ENSMUST00000108124 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Timeless-205ENSMUST00000105244 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 AC126804.1-201ENSMUST00000216609 2079 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Mark1-201ENSMUST00000027929 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Rpgr-203ENSMUST00000073392 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 AY702103-202ENSMUST00000180996 5876 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Prokr2-203ENSMUST00000110157 4005 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Rsf1-201ENSMUST00000107153 11124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Epha5-203ENSMUST00000113399 5166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Fam129a-205ENSMUST00000148810 6531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Arfgef2-201ENSMUST00000099078 8770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf122-201ENSMUST00000046941 3582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Mir763-201ENSMUST00000103249 120 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12275-201ENSMUST00000119805 307 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Elf5-207ENSMUST00000171693 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Csnk2b-203ENSMUST00000173114 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39094-202ENSMUST00000206679 624 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39164-202ENSMUST00000211519 236 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 AC154598.2-201ENSMUST00000227114 604 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1373-201ENSMUST00000078264 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp949-204ENSMUST00000162827 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Nuf2-201ENSMUST00000028000 2068 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Kcns3-203ENSMUST00000217974 2314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Nod2-202ENSMUST00000109634 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Drp2-202ENSMUST00000113224 4147 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Sult5a1-201ENSMUST00000000755 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Ctnnd1-214ENSMUST00000111688 6146 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Il1rl1-202ENSMUST00000097772 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Acsl6-207ENSMUST00000101213 2730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem181b-ps-202ENSMUST00000180035 2426 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Ovol1-201ENSMUST00000025861 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Hdac7-204ENSMUST00000116409 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Mefv-201ENSMUST00000023180 3126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Magea5-201ENSMUST00000069556 1360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem268-202ENSMUST00000080336 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Zwint-201ENSMUST00000020081 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Adgrf2-201ENSMUST00000113614 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Orc1-201ENSMUST00000102744 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Lcp1-202ENSMUST00000124499 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc28a-201ENSMUST00000052648 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Vegfd-201ENSMUST00000033751 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Tshz2-201ENSMUST00000109157 5083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Glb1l2-205ENSMUST00000162252 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Slc17a1-202ENSMUST00000110413 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7645-201ENSMUST00000119008 788 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28618-201ENSMUST00000189283 567 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37442-201ENSMUST00000191915 567 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6187-201ENSMUST00000040649 960 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6083-201ENSMUST00000075518 357 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr319-201ENSMUST00000076965 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 2310057M21Rik-201ENSMUST00000059438 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms