Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim71Q1PSW8 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms