Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms