Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Cntn3Q07409 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Cntn3Q07409 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Cntn3Q07409 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Cntn3Q07409 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Cntn3Q07409 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Cntn3Q07409 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
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Cntn3Q07409 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
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Cntn3Q07409 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Cntn3Q07409 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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Cntn3Q07409 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Cntn3Q07409 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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