Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
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