Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Pilrb1-201ENSMUST00000110978 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm13458-201ENSMUST00000118239 367 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm14645-201ENSMUST00000118597 417 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm11901-201ENSMUST00000120412 437 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm14414-201ENSMUST00000120833 573 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Mir6912-201ENSMUST00000184456 70 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Avpr1b-202ENSMUST00000190410 623 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 I830127L07Rik-202ENSMUST00000190944 405 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm7478-201ENSMUST00000201054 581 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Mcee-204ENSMUST00000206882 391 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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VdrP48281 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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VdrP48281 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm15624-201ENSMUST00000145420 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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