Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Olfr675-201ENSMUST00000073102 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Usp4P35123 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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Usp4P35123 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm21742-201ENSMUST00000189352 548 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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