Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ggta1P23336 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms