Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pou3f1P21952 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms