Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TP20293 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TP20293 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TP20293 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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