Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms