Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
H2-Q1O19441 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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H2-Q1O19441 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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H2-Q1O19441 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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H2-Q1O19441 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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H2-Q1O19441 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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