Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Trps1-206ENSMUST00000184458 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm43766-201ENSMUST00000200590 5417 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Zfp592-201ENSMUST00000107353 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm38003-201ENSMUST00000191968 1504 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.7 ms