Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms