Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm12126-201ENSMUST00000147717 619 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 AC122372.1-201ENSMUST00000215344 280 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Dpp6-203ENSMUST00000120555 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Orc1-201ENSMUST00000102744 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Trpv1-202ENSMUST00000102526 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Morc2b-201ENSMUST00000053896 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Tecta-201ENSMUST00000042190 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Apol11b-202ENSMUST00000180949 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gbp6-201ENSMUST00000196520 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 1700034I23Rik-201ENSMUST00000099123 2348 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Nr1i3-208ENSMUST00000155126 2980 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Knstrn-206ENSMUST00000134661 4602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Fgf13-202ENSMUST00000119306 2091 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Ndst2-205ENSMUST00000225000 3661 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Sema5a-201ENSMUST00000067458 10809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Ripor2-203ENSMUST00000091694 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Txnip-202ENSMUST00000074519 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Ypel2-201ENSMUST00000018571 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Nxpe4-202ENSMUST00000215780 2875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Lmx1a-202ENSMUST00000111377 3200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm37978-201ENSMUST00000194736 2915 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Cd22-202ENSMUST00000108125 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Lipa-202ENSMUST00000178114 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Cwc22-204ENSMUST00000111821 3388 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Cep41-201ENSMUST00000031810 3447 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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