Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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Rnf6Q9DBU5 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Rnf6Q9DBU5 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Rnf6Q9DBU5 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Rnf6Q9DBU5 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Rnf6Q9DBU5 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Rnf6Q9DBU5 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Rnf6Q9DBU5 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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