Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm22748-201ENSMUST00000082493 136 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Pdgfd-201ENSMUST00000058692 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Akr1c19-202ENSMUST00000118663 5832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Afm-201ENSMUST00000113179 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Smg9Q9DB90 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Acad11-201ENSMUST00000047799 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm28190-201ENSMUST00000189766 722 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Smg9Q9DB90 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms