Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm23094-201ENSMUST00000157551 322 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm8870-201ENSMUST00000188170 775 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Fxyd4-208ENSMUST00000204950 586 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Cyb5r2-202ENSMUST00000208217 1178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Nxpe1-ps-202ENSMUST00000210160 956 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Cenpn-205ENSMUST00000212775 837 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 AC154506.2-201ENSMUST00000225481 1276 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 3110009E18Rik-202ENSMUST00000056038 401 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Olfr419-201ENSMUST00000061990 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm11961-201ENSMUST00000135775 1319 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm44141-201ENSMUST00000204231 1583 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Nop56Q9D6Z1 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Nop56Q9D6Z1 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Nop56Q9D6Z1 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Nop56Q9D6Z1 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm25842-201ENSMUST00000122590 322 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm15857-201ENSMUST00000133476 789 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm13269-201ENSMUST00000143458 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm26351-201ENSMUST00000157532 232 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm16573-203ENSMUST00000162231 807 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm3383-203ENSMUST00000178414 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm3194-201ENSMUST00000180143 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 D7Ertd128e-201ENSMUST00000189744 928 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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