Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Use1Q9CQ56 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Use1Q9CQ56 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms