Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Paf1Q8K2T8 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms