Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Tshz3Q8CGV9 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tshz3Q8CGV9 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tshz3Q8CGV9 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tshz3Q8CGV9 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tshz3Q8CGV9 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tshz3Q8CGV9 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tshz3Q8CGV9 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tshz3Q8CGV9 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tshz3Q8CGV9 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tshz3Q8CGV9 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tshz3Q8CGV9 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tshz3Q8CGV9 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tshz3Q8CGV9 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tshz3Q8CGV9 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tshz3Q8CGV9 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tshz3Q8CGV9 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tshz3Q8CGV9 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tshz3Q8CGV9 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tshz3Q8CGV9 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tshz3Q8CGV9 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tshz3Q8CGV9 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Tshz3Q8CGV9 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tshz3Q8CGV9 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tshz3Q8CGV9 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms