Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gmfb-201ENSMUST00000079314 4171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm40603-202ENSMUST00000219975 1642 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Arsj-201ENSMUST00000093976 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Mbnl3-202ENSMUST00000114875 4649 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Slc44a1-202ENSMUST00000107645 2365 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Pla2r1-201ENSMUST00000112525 7112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Mkrn2-201ENSMUST00000000449 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm44812-201ENSMUST00000207627 5349 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Rab2b-202ENSMUST00000100631 2619 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 AC154461.6-201ENSMUST00000224815 2630 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 n-R5s102-201ENSMUST00000101990 119 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm22471-201ENSMUST00000104116 130 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Slc50a1-202ENSMUST00000107460 785 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm13243-201ENSMUST00000117481 565 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm12098-201ENSMUST00000118277 508 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm15355-201ENSMUST00000118929 285 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Sycn-201ENSMUST00000119180 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm13240-201ENSMUST00000120042 565 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm6136-201ENSMUST00000120149 891 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm11209-201ENSMUST00000130206 431 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Glipr1l2-202ENSMUST00000148897 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm20451-201ENSMUST00000173452 273 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Six3os1-213ENSMUST00000177487 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 n-R5s101-201ENSMUST00000177910 119 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 n-R5s114-201ENSMUST00000178297 119 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 n-R5s119-201ENSMUST00000178861 119 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 n-R5s127-201ENSMUST00000179185 119 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 n-R5s129-201ENSMUST00000180122 119 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 n-R5s131-201ENSMUST00000180280 119 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm27150-201ENSMUST00000183441 1038 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm27228-201ENSMUST00000184500 1038 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm28477-201ENSMUST00000188125 406 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm37155-201ENSMUST00000192152 406 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm45227-201ENSMUST00000205585 169 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Rps7-ps1-201ENSMUST00000211928 391 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 AC123944.1-201ENSMUST00000213414 160 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Spp2-201ENSMUST00000027518 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Ccl17-201ENSMUST00000034232 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Ucn2-201ENSMUST00000052724 1155 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Krtap7-1-201ENSMUST00000056118 620 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm5862-201ENSMUST00000072286 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm28307-201ENSMUST00000190685 2694 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Rbm12-201ENSMUST00000059647 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Psg19-203ENSMUST00000182853 1518 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm10513-201ENSMUST00000194203 6468 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm17137-201ENSMUST00000164106 4371 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm8366-201ENSMUST00000118751 1769 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Smco3-203ENSMUST00000203468 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Ccdc28a-201ENSMUST00000052648 2255 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 CT025600.1-202ENSMUST00000220264 2510 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gzmk-202ENSMUST00000122399 1304 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Teddm1a-201ENSMUST00000050660 1317 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Ablim1-203ENSMUST00000104902 5907 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 E330035G20Rik-201ENSMUST00000221094 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Serinc4-201ENSMUST00000056312 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm26672-202ENSMUST00000180931 3602 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm17259-201ENSMUST00000181520 4608 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Tubgcp5-201ENSMUST00000032627 3905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Il1rl1-203ENSMUST00000173514 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ClmQ7TSN2 Alcam-207ENSMUST00000170035 1917 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms