Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-67-201ENSMUST00000103538 294 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm24373-201ENSMUST00000104393 132 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm12075-201ENSMUST00000117426 397 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm11259-201ENSMUST00000120554 715 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 6430503K07Rik-201ENSMUST00000144411 476 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm43809-201ENSMUST00000200694 338 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Cd200r4-203ENSMUST00000176819 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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