Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim71Q1PSW8 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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