Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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Hoxd13P70217 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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Hoxd13P70217 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Hoxd13P70217 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
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Hoxd13P70217 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Hoxd13P70217 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Hoxd13P70217 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Hoxd13P70217 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Hoxd13P70217 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Hoxd13P70217 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Hoxd13P70217 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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