Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Nedd1P33215 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Tsx-201ENSMUST00000033691 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Nedd1P33215 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Nedd1P33215 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Nedd1P33215 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Nedd1P33215 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Nedd1P33215 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Nedd1P33215 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 G630018N14Rik-203ENSMUST00000221171 5888 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Nedd1P33215 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms