Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pabpc1P29341 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms