Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprmP28828 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
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PtprmP28828 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
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PtprmP28828 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
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PtprmP28828 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
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PtprmP28828 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PtprmP28828 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
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PtprmP28828 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
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