Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms