Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms