Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PtpraP18052 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PtpraP18052 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PtpraP18052 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PtpraP18052 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PtpraP18052 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PtpraP18052 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PtpraP18052 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtpraP18052 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PtpraP18052 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtpraP18052 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.9 ms