Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm44737-201ENSMUST00000206950 2355 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Zfp85os-201ENSMUST00000049518 2624 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Ift122-202ENSMUST00000112923 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Prps1l1-201ENSMUST00000134550 1676 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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