Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Ccl20O89093 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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Ccl20O89093 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Ccl20O89093 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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Ccl20O89093 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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