Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Zfp870J3QMA4 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms