Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Gm20830J3KML6 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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Gm20830J3KML6 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Gm20830J3KML6 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20830J3KML6 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Gm20830J3KML6 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Gm20830J3KML6 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Gm20830J3KML6 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm20830J3KML6 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Gm20830J3KML6 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm20830J3KML6 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm20830J3KML6 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm20830J3KML6 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm20830J3KML6 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Gm20830J3KML6 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm20830J3KML6 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm20830J3KML6 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Gm20830J3KML6 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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Gm20830J3KML6 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm20830J3KML6 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm20830J3KML6 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm20830J3KML6 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm20830J3KML6 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm20830J3KML6 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm20830J3KML6 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm20830J3KML6 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm20830J3KML6 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm20830J3KML6 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm20830J3KML6 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms