Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Erc1-201ENSMUST00000032279 8356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Map3k7-203ENSMUST00000108183 5416 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Rtl3-201ENSMUST00000062010 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Specc1-207ENSMUST00000201364 4955 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms