Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Clrn2B2RVW2 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Clrn2B2RVW2 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Clrn2B2RVW2 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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