Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Olfr956-ps1-201ENSMUST00000216492 867 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms