Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CtcflA2APF3 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
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