Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Ank3-247ENSMUST00000218680 5500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
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Col5a3Q9JLI2 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Mbnl1-218ENSMUST00000194069 5460 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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Col5a3Q9JLI2 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Krr1-203ENSMUST00000163048 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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Col5a3Q9JLI2 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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Col5a3Q9JLI2 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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Col5a3Q9JLI2 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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Col5a3Q9JLI2 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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Col5a3Q9JLI2 Zkscan2-201ENSMUST00000042470 7831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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Col5a3Q9JLI2 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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