Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Trim12aQ99PQ1 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Trim12aQ99PQ1 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Trim12aQ99PQ1 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Trim12aQ99PQ1 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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