Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Itsn1-208ENSMUST00000114002 14012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Atl3-201ENSMUST00000025668 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 AC159886.2-201ENSMUST00000214737 2740 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Ttll4-201ENSMUST00000042125 10019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NischQ80TM9 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms