Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 AC134254.3-201ENSMUST00000223533 575 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 CT009556.2-201ENSMUST00000227980 1123 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Gm12582-201ENSMUST00000030555 697 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Uroc1-202ENSMUST00000164761 3462 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Ufm1-203ENSMUST00000146598 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Znf48Q3US17 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Mical2-201ENSMUST00000037991 3352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Znf48Q3US17 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Mtpn-201ENSMUST00000031866 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Znf48Q3US17 Patj-206ENSMUST00000107033 3624 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Prkaa2-201ENSMUST00000030243 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Znf48Q3US17 Gm17034-201ENSMUST00000168990 2229 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Znf48Q3US17 Dlg2-202ENSMUST00000098308 2329 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Znf48Q3US17 Elf5-207ENSMUST00000171693 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Znf48Q3US17 Sfta2-202ENSMUST00000174521 649 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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Znf48Q3US17 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Gm26726-201ENSMUST00000181889 395 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Scgb2b30-201ENSMUST00000187013 336 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Scgb2b10-201ENSMUST00000191403 318 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Gm43711-201ENSMUST00000195994 373 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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